D

【分析】此题考查的生物进化的知识，在研究生物的进化的过程中，化石是重要的证据，据此作答。

【详解】在研究生物的进化的过程中，化石是重要的证据，科学家们发现，越古老的地层中，形成化石的生物越简单、低等、水生生物较多；越晚近的地层中，形成化石的生物越复杂、高等、陆生生物较多。因此证明生物进化的总体趋势是从简单到复杂，从低等到高等，从水生到陆生，选项中最高等的是鱼类。因此随着钻入的地层加深，鱼类生物的化石最早消失。

故选 D 。

A

【分析】（ 1 ）生物的进化是长期自然选择的结果。

（ 2 ）生物进化的证据是多方面的，如化石能证明生物进化的历程和趋势以及生物之间的亲缘关系等。

【详解】 A ．米勒实验中，密闭的实验装置内模拟的是原始大气，原始大气的主要成分有水蒸气、氢气、甲烷、氨气等，但是没有氧气， A 错误．

B ．生物进化的证据主要有化石证据、比较解剖学证据、分子生物学证据，其中化石证据是最直接的证据， B 正确。

C ．脊椎动物的进化历程：原始鱼类 → 原始两栖类 → 原始爬行类 → 鸟类和哺乳类，地球上最早出现的脊椎动物是古代的鱼类， C 正确。

D ．适者生存，不适者被淘汰是自然选择，生物进化是长期自然选择的结果， D 正确。

故选 A 。

D

【分析】达尔文认为，任何一种生物在生活过程中都必须为生存而斗争。在生存斗争中，具有有利变异的个体，容易在生存斗争中获胜而生存下去；反之，具有不利变异的个体，则容易在生存斗争中失败而死亡。这就是说，凡是生存下来的生物都是适应环境的，而被淘汰的生物都是对环境不适应的，这就是适者生存。达尔文把在生存斗争中，适者生存、不适者被淘汰的过程叫做自然选择。

【详解】在自然界中生物赖以生存的食物和空间都是非常有限的，任何生物要生存下去都要为争夺足够的食物和空间进行生存斗争，生存斗争包括生物同种个体和不同种个体之间的斗争，以及生物与自然条件，在生存斗争中，具有有利变异的个体容易生存下来并繁殖后代，同时将有利变异遗传给下一代，而具有不利变异的个体则容易被淘汰，通过上述事实说明，自然界中动物有奇特的保护色是受环境影响，产生的遗传和变异，且通过自然选择实现的；而不是人为干涉的，故与产生动物有奇特的保护色无必然联系的是人工选择，即 D 符合题意。

故选 D 。

D

【分析】生物进化遵循由简单到复杂，由低等到高等，由水生到陆生的规律。

【详解】题中给出的条件，从古生代早期、中期到晚期的植物有从水生到陆生的特点。最早期的是藻类植物，最低等；最晚期的是被子植物，最高等。但是，不能得出 “ 蕨类植物和裸子植物与藻类植物之间的进化关系 ” 。

故选 D 。

C

【分析】自然界中的生物，通过激烈的生存斗争，适应者生存下来，不适应者被淘汰掉，这就是自然选择；长颈鹿的颈很长，是在长期的生存斗争中自然选择的结果。

【详解】达尔文认为：古代的长颈鹿存在着颈长和颈短、四肢长和四肢短的变异，这些变异是可以遗传的，四肢和颈长的能够吃到高处的树叶，就容易生存下去，并且繁殖后代；四肢和颈短的个体，吃不到高处的树叶，当环境改变食物缺少时，就会因吃不到足够的树叶而导致营养不良，体质虚弱，本身活下来的可能性很小，留下后代的就会就更小，经过许多代以后，四肢和颈短的长颈鹿就被淘汰了，这样，长颈鹿一代代的进化下去，就成了今天我们看到的长颈鹿，因此长颈鹿的颈很长是自然选择的结果。

故选 C 。